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黑龍江水產研究所于1950年成立，是我國建立zui早的淡水水產科研機構，是國家黑龍江流域漁業綜合科研機構。 研究所主要從事淡水魚類特別是冷水性魚類及寒冷地區魚類基礎生物學、遺傳與生物技術育種、種質資源保存與持續利用、魚類增養殖技術等方面的公益性、基礎性和應用基礎研究工作。 建所以來共承擔國家及省部級科研任務400余項，有100余項成果獲得各級各類獎勵，取得各級各類獎勵100余項，其中*獎勵5項，省部級獎勵44項。 研究所內設有養殖、生物技術、育種和資源與環境4個研究室。農業部北方魚類生物工程育種重點開放實驗室、院冷水性魚類增養殖重點開放實驗室，農業部漁業環境及水產品質量監督檢驗測試中心、農業部漁業環境監測中心黑龍江流域監測站。 全所固定資產 2199萬元，擁有萬元以上的科研儀器70余臺（套），圖書館藏書16131冊。 1996年研究所在農業部對全國1100余個科研機構的科研、開發綜合能力評估中列“全國農業系統研究所"第24位，1997年被原國家科委確定為改革與發展重點研究所。
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